Na década de 1990, as ONGs tiveram papel central na consolidação do Subsistema de Saúde Indígena, assessorando o movimento indígena, denunciando violações e pressionando o Estado por melhorias nas condições de saúde. Além disso, atuaram na terceirização de serviços, firmando convênios com a Funasa para atendimento indígena, sobretudo na Região Amazônica, em articulação com as lutas pela preservação da floresta e dos povos indígenas.
Infuência maior de ONGs na saúde e saneamento indígena
Ano de início: 1990
Ano de fim: 1999
Documento: SAÚDE INDÍGENA EM PERSPECTIVA: EXPLORANDO SUAS MATRIZES HISTÓRICAS E IDEOLÓGICAS. / organizado por Carla Costa Teixeira e Luiza Garnelo— Rio de Janeiro: Editora FIOCRUZ, 2014, 262 p. : il. ; tab. (Coleção Saúde dos Povos Indígenas) ISBN: 978-85—7541—449—1. Disponível em: https://books.scielo.org/id/4q4z4 Exemplos: https://www.socioambiental.org/ e https://saudeealegria.org.br/