Em paralelo à recém-criada Cisi, instituiu-se a Comissão Intersetorial de Saúde (CIS), presidida pela Funai. A CIS, por meio da Resolução n° 2, de 1994, aprovou o “Modelo de Atenção Integral à Saúde do Índio”, que atribuía à Funai, a assistência curativa, e, à FNS, as ações preventivas, de vigilância epidemiológica e saneamento básico, o que indica as diferentes concepções institucionais. Neste período de 5 anos, a FNS, por meio do Departamento de Saneamento e da Coordenação de Saúde do Índio, realizou obras de abastecimento de água, melhorias sanitárias e edificações em aldeia de 143 municípios, o que totalizou um investimento de R$ 14.633.538,61.
Saúde Indígena retorna à Funai
Ano de início: 1994
Fonte: https://bvsms.saude.gov.br/bvs/saudelegis/gm/2017/prc0002_03_10_2017.html#ANEXOXIV; https://repositorio.funasa.gov.br/bitstream/handle/123456789/586/Saneamento%20em%20%C3%A1reas%20%C3%ADndigenas%20do%20Brasil.%20Hist%C3%B3rico%20da%20atua%C3%A7%C3%A3o%20da%20Funasa%20e%20perspectivas%202009.pdf?sequence=1&isAllowed=y